Microbiome

본문

XE ProxiMetaTm Whole Genome Analyzer

Illumina Hiseq 플랫폼 등을 이용하여 염기서열 데이터 생산 및 분석을 진행합니다. Microbiome에서 Reference 수준의 genome 정보를 분석할 수 있으며 배양이 불가능한 세균의 genome 정보를 확보할 수 있습니다. 통계 분석을 통한 개체 별 미생물의 종 수준 분석에 용이합니다.

micro_01.png
  • * 분석하려는 샘플을 배양할 필요가 없습니다.
  • * HMW(High Molecular Weight)-DNA와 별도의 전용장비가 필요하지 않습니다.
  • * 복합 Microbiome 시료에서 즉시 novel genomes 분석이 가능합니다.
  • * Mixed population에서 reference 수준의 genome을 확보할 수 있습니다.
  • * Library 준비 과정 및 sequencing 진행이 보다 간편합니다.
  • * Microbiome 외 다양한 시료에서 응용이 가능합니다.

micro_02.png



XE LoopSeqTm Microbiome Analyzer (Bacteria & Fungi)

list_shape.png Bacteria LoopSeq

Bacterial 16S ribosomal RNA의 V1~V9 region의 library를 제작한 후, Illumina Hiseq 플랫폼을 기반으로 longread sequencing 분석 방식을 이용하기 때문에 다양한 연구분야에 적용 가능합니다. Sample 별 sequencing read mapping이 이루어지기 때문에 미생물 균총 추정이 가능합니다. LoopSeq 16S Microbiome 24-plex Kit를 이용하면 한번에 최대 24개의 시료 분석이 가능합니다.

list_shape.png Fungi LoopSeq

기존 NGS 장비를 사용한 long read sequencing 분석 방식을 이용하여 Bacterial 18S ribosomal RNA 및 ITS region의 full-length 염기서열을 모두 분석 가능합니다. 여러 분류체계에서 개체별 균총 구성 비율을 확인할 때용이하며, 통계 분석을 통해 개체 별 차등적으로 존재하는 Fungi를 탐색하는데 효과적입니다. LoopSeq 18S-ITS1-ITS2 Microbiome Kit를 이용하면 한번에 최대 24개의 시료 분석이 가능합니다.

micro_03.png

micro_04.png
  • * 1 Tube에서 최대 24개까지 폭넓은 시료 분석이 가능합니다.
  • * 신속하고 정확한 Long-read sequencing 기술입니다.
  • * 기존의 Short read 획득 방식으로 분석되는 일부 variable region(ITS1, 18S fragment 등) 연구가 아닌 18S ribosomal RNA 및 ITS전체 염기서열 정보의 분석이 가능합니다.
  • * 본 분석기술은 여러가지 연구 분야에 적용이 가능합니다. (18S RNA sequencing, microbiome study, amplicons 등)